Home Perikanan Metode Baru untuk Mengidentifikasi Bakteri Dalam Akuakultur

Metode Baru untuk Mengidentifikasi Bakteri Dalam Akuakultur

Agrozine.id – Startup KYTOS menemukan sebuah metode baru mengidentifikasi bakteri dalam akuakultur dengan menggunakan sidik jari sitometrik aliran mutakhir untuk mengkarakterisasi mikrobiom dalam sampel air. Menurut Prof Nico Boon dari Pusat Ekologi dan Teknologi Mikroba (CMET) Universitas Ghent teknik ini berpotensi untuk menggantikan sekaligus melengkapi teknis analisis mikroba yang sudah ada.

Selain itu, teknologi ini disebut akan menarik bagi petani karena menyediakan peringatan dini, jika ketidakseimbangan bakteri yang cenderung menunjukkan wabah penyakit yang akan segera terjadi.

Teknik Pemantauan Bakteri yang Sudah Ada

Prof Boon menjelaskan bahwa teknik mengidentifikasi bakteri sudah banyak. Meski kadang teknik tersebut efektif, namun tetap memiliki kekurangan terutama dalam hal waktu yang dibutuhkan untuk memberikan hasil.

“Jika anda ingin melihat bakteri atau alga, anda punya beberapa pilihan. Teknik yang paling umum digunakan adalah kultur. Kami membudidayakan bakteri di piring agar-agar, kami telah melakukannya selama 200 tahun. Misalnya untuk memeriksa kualitas makanan dan air minum, kami masih menggunakan teknik itu”, kata Prof Boon.

“Tetapi ada beberapa masalah dengan itu. Ini cukup memakan waktu, jadi anda harus menunggu setidaknya satu hari sebelum anda mendapatkan hasil. Dan banyak orang melupakan ini, tetapi sebagian besar bakteri di alam tidak dapat dibiakkan menggunakan praktik biasa. Patogen yang telah kami tangani selama 200 tahun, tetapi banyak bakteri alami yang mendorong proses biogeokimia yang masih belum dapat kami kultur, sehingga sebagian besar masih tersembunyi”, tambahnya.

Sementara teknik identifikasi yang lebih maju telah dikembangkan, juga memiliki kekurangan khususnya untuk sektor dimana tantangan kesehatan dapat muncul dengan sangat cepat.

“Untungnya sekitar 20 tahun lalu, teknik molekuler menjadi lebih populer dan sekarang kami memiliki banyak teknik. Prinsipnya mudah, anda dapat mengambil sampel dan memperkuat semua materi genetik dan melihat apa yang ada disana. Dalam lingkungan akademis bagus, tapi sekali lagi itu memakan waktu. Dibutuhkan lebih banyak waktu untuk melakukan ini dalam banyak kasus daripada melakukan pembiakan. Itu juga cukup terspesialisasi dan tidak murah”, kata Prof Boon.

Baca Juga: Parameter Kualitas Air untuk Memastikan Kelancaran Sistem 
Resirkulasi Akuakultur (RAS)

Berangkat dari permasalahan tersebut, Prof Boon dan timnya di CMET mulai mempertimbangkan penggunaan metode mengidentifikasi bakteri akuakultur dan alat-alat lain dalam identifikasi bakteri akukultur.

“Saya mulai memikirkan apakah kami memiliki teknik lain yang jauh lebih cepat dan lebih murah, tetapi masih dapat menghasilkan informasi yang berguna. Sebab di industri, untuk mengelola komunitas (mikroba) hasilnya harus cepat agar bisa bertindak”, ungkapnya.

Teknik baru yang ditemukan tersebut adalah Flow cytometry yang memungkinkan sampel air bisa dianalisis dalam waktu 15 menit dengan menggunakan laser untuk mendeteksi setiap sel dalam sampel bakteri atau mikroba tertentu.

Baca Juga: Konsep Akuakultur Perkotaan Untuk Budidaya Udang

√Źni adalah metode mengidentifikasi bakteri akuakultur yang sangat umum digunakan dalam penelitian medis. Tetapi untuk bakteri,teknis ini terlalu sering digunakan. Teknik ini sangat cepat, anda bahkan dapat menggunakannya secara online. Jika anda memberi saya sampel anda, saya dapat memberi tahu anda hasilnya dalam 15-20 menit. Ada juga banyak informasi dalam data ini karena kami menganalisis setidaknya 1000 sel per detik dan kami memiliki data dari 30.000 sel. Berdasarkan hal ini kami dapat membuat sidik jari mikroba/sampel dengan sangat cepat”, jelasnya.

 

Uji Komersial

Para peneliti baru-baru ini melakukan uji coba terhadap teknologi Flow cytometry di beberapa operasi udang komersial dan mampu menentukan tangki pembenihan dan kolam pembesaran tempat berkembangnya bakteri. Para peneliti ini menggunakan alat tersebut dalam pengaturan komersial untuk mengevaluasi sejauh mana alat tersebut dapat digunakan untuk mencegah wabah penyakit pada udang.

Baca Juga: Ace Aquatec : Cara Baru untuk Pecahkan Permasalahan Akuakultur

“Masih ada sedikit pekerjaan yang harus dilakukan. Tetapi kami pikir dalam waktu dekat kami akan menerjemahkan sidik jari mikroba yang kompleks ini menjadi saran manajemen khusus yang memberdayakan petani dengan manajemen mikroba yang dapat ditindaklanjuti”, jelas Prof Boon.

Ditambahkannya bahwa setelah uji coba ini, para peneliti akan mendiskusikan implementasi komersial dengan mitra petani untuk penerapan teknologi tersebut sebagai metode baru mengidentifikasi bakteri dalam akuakultur budidaya udang. (ira)

 

Tonton video menarik ini:

 

LEAVE A REPLY

Please enter your comment!
Please enter your name here